Publications by authors named "Philippe N Bertin"

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Complete Genome Sequence of sp. Strain Nx66, Isolated from Waters Contaminated with Petrochemicals in El Saf-Saf Valley, Algeria.

Authors:
Nardjess Chéraiti Frédéric Plewniak Salima Tighidet Amalia Sayeh Lisa Gil Ludivine Malherbe Yosr Memmi Laurence Zilliox Céline Vandecasteele Pierre Boyer Céline Lopez-Roques Benoît Jaulhac Mourad Bensouilah Philippe N Bertin

Microbiol Resour Announc 2020 Nov 19;9(47). Epub 2020 Nov 19.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, Université de Strasbourg, Strasbourg, France

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November 2020

In situ metabolic activities of uncultivated Ferrovum sp. CARN8 evidenced by metatranscriptomic analysis.

Authors:
Frédéric Plewniak Sandrine Koechler Denis Le Paslier Marina Héry Odile Bruneel Philippe N Bertin

Res Microbiol 2020 Jan - Feb;171(1):37-43. Epub 2019 Oct 10.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS Université de Strasbourg, Strasbourg, France.

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March 2020

A Genomic Outlook on Bioremediation: The Case of Arsenic Removal.

Authors:
Frédéric Plewniak Simona Crognale Simona Rossetti Philippe N Bertin

Front Microbiol 2018 26;9:820. Epub 2018 Apr 26.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.

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April 2018

Erratum to: Multiple controls affect arsenite oxidase gene expression in Herminiimonas arsenicoxydans.

Authors:
Sandrine Koechler Jessica Cleiss-Arnold Caroline Proux Odile Sismeiro Marie-Agnès Dillies Florence Goulhen-Chollet Florence Hommais Didier Lièvremont Florence Arsène-Ploetze Jean-Yves Coppé Philippe N Bertin

BMC Microbiol 2017 03 28;17(1):74. Epub 2017 Mar 28.

UMR7156 Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, CNRS Université de Strasbourg, 28 rue Goethe, 67000, Strasbourg, France.

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March 2017

The microbial genomics of arsenic.

Authors:
Jérémy Andres Philippe N Bertin

FEMS Microbiol Rev 2016 Mar 19;40(2):299-322. Epub 2016 Jan 19.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS Université de Strasbourg, 67083 Strasbourg, France

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March 2016

Arsenite response in Coccomyxa sp. Carn explored by transcriptomic and non-targeted metabolomic approaches.

Authors:
Sandrine Koechler Philippe N Bertin Frédéric Plewniak Raymonde Baltenweck Corinne Casiot Hermann J Heipieper Olivier Bouchez Florence Arsène-Ploetze Philippe Hugueney David Halter

Environ Microbiol 2016 Apr 15;18(4):1289-300. Epub 2016 Feb 15.

Unité Mixte de Recherche Santé de la Vigne et Qualité du Vin, Equipe Métabolisme secondaire de la vigne INRA, 68021, Colmar, France.

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April 2016

Recent advances in microbiology: towards new horizons?

Authors:
Philippe N Bertin

Res Microbiol 2015 Dec 19;166(10):727-8. Epub 2015 Oct 19.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156, 28 Rue Goethe, 67000, Strasbourg, France. Electronic address:

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December 2015

Thiomonas sp. CB2 is able to degrade urea and promote toxic metal precipitation in acid mine drainage waters supplemented with urea.

Authors:
Julien Farasin Jérémy Andres Corinne Casiot Valérie Barbe Jacques Faerber David Halter Dimitri Heintz Sandrine Koechler Didier Lièvremont Raphael Lugan Marie Marchal Frédéric Plewniak Fabienne Seby Philippe N Bertin Florence Arsène-Ploetze

Front Microbiol 2015 28;6:993. Epub 2015 Sep 28.

Laboratoire Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156, Université de Strasbourg - Centre National de la Recherche Scientifique, Institut de Botanique Strasbourg, France.

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October 2015

Adaptation in Toxic Environments: Arsenic Genomic Islands in the Bacterial Genus Thiomonas.

Authors:
Kelle C Freel Martin C Krueger Julien Farasin Céline Brochier-Armanet Valérie Barbe Jeremy Andrès Pierre-Etienne Cholley Marie-Agnès Dillies Bernd Jagla Sandrine Koechler Yann Leva Ghislaine Magdelenat Frédéric Plewniak Caroline Proux Jean-Yves Coppée Philippe N Bertin Hermann J Heipieper Florence Arsène-Ploetze

PLoS One 2015 30;10(9):e0139011. Epub 2015 Sep 30.

Laboratoire Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156, CNRS-Université de Strasbourg, Département Microorganismes, Génomes, Environnement, Equipe Ecophysiologie Moléculaire des Microorganismes, Institut de Botanique, Strasbourg, France.

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May 2016

Constitutive arsenite oxidase expression detected in arsenic-hypertolerant Pseudomonas xanthomarina S11.

Authors:
Sandrine Koechler Florence Arsène-Ploetze Céline Brochier-Armanet Florence Goulhen-Chollet Audrey Heinrich-Salmeron Bernard Jost Didier Lièvremont Muriel Philipps Frédéric Plewniak Philippe N Bertin Marie-Claire Lett

Res Microbiol 2015 Apr 6;166(3):205-14. Epub 2015 Mar 6.

UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS Génétique Moléculaire, Génomique, Microbiologie, Département Micro-organismes, Génomes, Environnement, 28 rue Goethe, 67083 Strasbourg Cedex, France. Electronic address:

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April 2015

Proteomic tools to decipher microbial community structure and functioning.

Authors:
Florence Arsène-Ploetze Philippe N Bertin Christine Carapito

Environ Sci Pollut Res Int 2015 Sep 5;22(18):13599-612. Epub 2014 Dec 5.

Génétique moléculaire, Génomique et Microbiologie, Université de Strasbourg, UMR7156 CNRS, Strasbourg, France,

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September 2015

Diversity and spatiotemporal dynamics of bacterial communities: physicochemical and other drivers along an acid mine drainage.

Authors:
Aurélie Volant Odile Bruneel Angélique Desoeuvre Marina Héry Corinne Casiot Noëlle Bru Sophie Delpoux Anne Fahy Fabien Javerliat Olivier Bouchez Robert Duran Philippe N Bertin Françoise Elbaz-Poulichet Béatrice Lauga

FEMS Microbiol Ecol 2014 Oct 9;90(1):247-63. Epub 2014 Sep 9.

Laboratoire HydroSciences Montpellier, HSM, UMR 5569 (IRD, CNRS, Universités Montpellier 1 et 2), Université Montpellier 2, Montpellier, France.

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October 2014

Arsenic hypertolerance in the protist Euglena mutabilis is mediated by specific transporters and functional integrity maintenance mechanisms.

Authors:
David Halter Jérémy Andres Frédéric Plewniak Julie Poulain Corinne Da Silva Florence Arsène-Ploetze Philippe N Bertin

Environ Microbiol 2015 Jun 28;17(6):1941-9. Epub 2014 Apr 28.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, Département Micro-organismes, Génomes, Environnement, UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, Strasbourg, France.

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June 2015

Genome Sequence of Halomonas sp. Strain A3H3, Isolated from Arsenic-Rich Marine Sediments.

Authors:
Sandrine Koechler Frédéric Plewniak Valérie Barbe Fabienne Battaglia-Brunet Bernard Jost Catherine Joulian Muriel Philipps Serge Vicaire Stéphanie Vincent Tao Ye Philippe N Bertin

Genome Announc 2013 Oct 10;1(5). Epub 2013 Oct 10.

UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, Génétique Moléculaire, Génomique, Microbiologie, Département Micro-organismes, Genome, Environnement, Strasbourg, France.

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October 2013

Metagenomic insights into microbial metabolism affecting arsenic dispersion in Mediterranean marine sediments.

Authors:
Frédéric Plewniak Sandrine Koechler Benjamin Navet Eric Dugat-Bony Olivier Bouchez Pierre Peyret Fabienne Séby Fabienne Battaglia-Brunet Philippe N Bertin

Mol Ecol 2013 Oct 3;22(19):4870-83. Epub 2013 Sep 3.

Département Microorganismes, Génomes, Environnement, Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, 28 rue Goethe, 67083, Strasbourg Cedex, France.

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October 2013

Life in an arsenic-containing gold mine: genome and physiology of the autotrophic arsenite-oxidizing bacterium rhizobium sp. NT-26.

Authors:
Jérémy Andres Florence Arsène-Ploetze Valérie Barbe Céline Brochier-Armanet Jessica Cleiss-Arnold Jean-Yves Coppée Marie-Agnès Dillies Lucie Geist Aurélie Joublin Sandrine Koechler Florent Lassalle Marie Marchal Claudine Médigue Daniel Muller Xavier Nesme Frédéric Plewniak Caroline Proux Martha Helena Ramírez-Bahena Chantal Schenowitz Odile Sismeiro David Vallenet Joanne M Santini Philippe N Bertin

Genome Biol Evol 2013 ;5(5):934-53

Laboratoire Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS Université de Strasbourg, Strasbourg, France.

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December 2013

Bacterial metabolism of environmental arsenic--mechanisms and biotechnological applications.

Authors:
Martin C Kruger Philippe N Bertin Hermann J Heipieper Florence Arsène-Ploetze

Appl Microbiol Biotechnol 2013 May 2;97(9):3827-41. Epub 2013 Apr 2.

Department of Environmental Biotechnology, Helmholtz Centre for Environmental Research-UFZ, Permoserstr. 15, 04318 Leipzig, Germany.

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May 2013

Genome Sequence of the Sulfate-Reducing Bacterium Desulfotomaculum hydrothermale Lam5(T).

Authors:
Oulfat Amin Marie-Laure Fardeau Odile Valette Agnès Hirschler-Réa Valérie Barbe Claudine Médigue Benoit Vacherie Bernard Ollivier Philippe N Bertin Alain Dolla

Genome Announc 2013 Jan 24;1(1). Epub 2013 Jan 24.

Aix-Marseille Université, Université Sud Toulon, CNRS/INSU, IRD, MIO-UM110, Marseille, France.

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January 2013

Role of polyadenylation in regulation of the flagella cascade and motility in Escherichia coli.

Authors:
Alexandre Maes Céline Gracia Dominique Bréchemier Philippe Hamman Elodie Chatre Laurence Lemelle Philippe N Bertin Eliane Hajnsdorf

Biochimie 2013 Feb 30;95(2):410-8. Epub 2012 Oct 30.

CNRS UPR9073, associated with University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Institut de Biologie Physico-Chimique, 13 rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris, France.

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February 2013

In situ proteo-metabolomics reveals metabolite secretion by the acid mine drainage bio-indicator, Euglena mutabilis.

Authors:
David Halter Florence Goulhen-Chollet Sébastien Gallien Corinne Casiot Jérôme Hamelin Françoise Gilard Dimitri Heintz Christine Schaeffer Christine Carapito Alain Van Dorsselaer Guillaume Tcherkez Florence Arsène-Ploetze Philippe N Bertin

ISME J 2012 Jul 12;6(7):1391-402. Epub 2012 Jan 12.

UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, Département Micro-organismes, Génomes, Environnement, Strasbourg, France.

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July 2012