Publications by authors named "Frederic Plewniak"

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In situ metabolic activities of uncultivated Ferrovum sp. CARN8 evidenced by metatranscriptomic analysis.

Res Microbiol 2020 Jan - Feb;171(1):37-43. Epub 2019 Oct 10.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS Université de Strasbourg, Strasbourg, France.

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March 2020

A Genomic Outlook on Bioremediation: The Case of Arsenic Removal.

Front Microbiol 2018 26;9:820. Epub 2018 Apr 26.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.

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April 2018

Arsenite response in Coccomyxa sp. Carn explored by transcriptomic and non-targeted metabolomic approaches.

Environ Microbiol 2016 Apr 15;18(4):1289-300. Epub 2016 Feb 15.

Unité Mixte de Recherche Santé de la Vigne et Qualité du Vin, Equipe Métabolisme secondaire de la vigne INRA, 68021, Colmar, France.

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April 2016

Thiomonas sp. CB2 is able to degrade urea and promote toxic metal precipitation in acid mine drainage waters supplemented with urea.

Front Microbiol 2015 28;6:993. Epub 2015 Sep 28.

Laboratoire Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156, Université de Strasbourg - Centre National de la Recherche Scientifique, Institut de Botanique Strasbourg, France.

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October 2015

Adaptation in Toxic Environments: Arsenic Genomic Islands in the Bacterial Genus Thiomonas.

PLoS One 2015 30;10(9):e0139011. Epub 2015 Sep 30.

Laboratoire Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156, CNRS-Université de Strasbourg, Département Microorganismes, Génomes, Environnement, Equipe Ecophysiologie Moléculaire des Microorganismes, Institut de Botanique, Strasbourg, France.

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May 2016

Constitutive arsenite oxidase expression detected in arsenic-hypertolerant Pseudomonas xanthomarina S11.

Res Microbiol 2015 Apr 6;166(3):205-14. Epub 2015 Mar 6.

UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS Génétique Moléculaire, Génomique, Microbiologie, Département Micro-organismes, Génomes, Environnement, 28 rue Goethe, 67083 Strasbourg Cedex, France. Electronic address:

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April 2015

Arsenic hypertolerance in the protist Euglena mutabilis is mediated by specific transporters and functional integrity maintenance mechanisms.

Environ Microbiol 2015 Jun 28;17(6):1941-9. Epub 2014 Apr 28.

Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, Département Micro-organismes, Génomes, Environnement, UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, Strasbourg, France.

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June 2015

Genome Sequence of Halomonas sp. Strain A3H3, Isolated from Arsenic-Rich Marine Sediments.

Genome Announc 2013 Oct 10;1(5). Epub 2013 Oct 10.

UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, Génétique Moléculaire, Génomique, Microbiologie, Département Micro-organismes, Genome, Environnement, Strasbourg, France.

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October 2013

Metagenomic insights into microbial metabolism affecting arsenic dispersion in Mediterranean marine sediments.

Mol Ecol 2013 Oct 3;22(19):4870-83. Epub 2013 Sep 3.

Département Microorganismes, Génomes, Environnement, Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, 28 rue Goethe, 67083, Strasbourg Cedex, France.

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October 2013

Surface properties and intracellular speciation revealed an original adaptive mechanism to arsenic in the acid mine drainage bio-indicator Euglena mutabilis.

Appl Microbiol Biotechnol 2012 Feb 27;93(4):1735-44. Epub 2011 Jul 27.

Département Microorganismes, Génomes, Environnement UMR7156 Université de Strasbourg/CNRS, Strasbourg, France.

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February 2012

seqMINER: an integrated ChIP-seq data interpretation platform.

Nucleic Acids Res 2011 Mar 21;39(6):e35. Epub 2010 Dec 21.

Department of Functional Genomics and Cancer, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS UMR 7104, INSERM U 596, Université de Strasbourg, BP 10142-67404 ILLKIRCH Cedex, CU de Strasbourg, France.

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March 2011

Knowledge-based expert systems and a proof-of-concept case study for multiple sequence alignment construction and analysis.

Brief Bioinform 2009 Jan 29;10(1):11-23. Epub 2008 Oct 29.

Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), F-67400 Illkirch, France.

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January 2009

Database similarity searches.

Methods Mol Biol 2008 ;484:361-78

Plate-forme Bio-informatique de Strasbourg, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, UMR 7104 - CNRS - Inserm - ULP, France.

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February 2009

SAGETTARIUS: a program to reduce the number of tags mapped to multiple transcripts and to plan SAGE sequencing stages.

Nucleic Acids Res 2007 20;35(18):e122. Epub 2007 Sep 20.

Plate-forme Bioinformatique de Strasbourg, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (CNRS/INSERM/ULP) BP 163, 67404 Illkirch Cedex, France.

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November 2007